以前触れたHyper-V Server 2008がMSDNに公開されたなと思っていたら、実はサイトでもひっそりと公開されていたようです。
まだ日本語サイトは無いようですが以下のサイトからダウンロードが可能です。
Hyper-V Server 2008単体はまだ使ったことが無いのでなんとも言えませんが管理面を除けばOSサポート具合等からするとESXiの方が有利かもしれません。
ただ、ドメインに参加出来たり、リモートデスクトップの利用やMMCからのGUI操作が出来るのであれば価値はある選択かもしれません。
それ以外については・・・シェルが好きかVBスクリプトやPower Shellが好きか、とか、結局エンジニアによるのかもしれませんね。